Obwohl die pauschal bemessene Abgeltungssteuer auf deutsches Schwarzgeld in der Schweiz erhöht wurde, ist der innenpolitische Streit um das Abkommen damit aber noch nicht beigelegt. So kündigten die rot-grün regierten Bundesländer bereits an, dem Abkommen im Bundesrat die Zustimmung zu verweigern.

Auch in der Schweiz stößt die Vertragsergänzung auf Kritik. Die Regierung habe schlecht verhandelt, so der Zürcher Finanzmarktprofessor Martin Janssen. Das Steuerabkommen unterminiere die Souveränität der Schweiz und gefährde Arbeitsplätze.